FYMNSA está ubicada en una zona cuya vegetación dominante está definida por la ocurrencia de praderas y matorrales, mientras que el bosque nativo aparece de forma de monte de quebradas, ribereño y serrano, los cuales acompañan laderas y cursos de agua.

En la región ha habido estudios fitosociológicos que coinciden en señalar la existencia de numerosas especies de gran valor como :

Nectandra megapotamica (Laurel Blanco) Cinnamomum spp (Laureles), Lithraea molleoides (Aruera), Cupania vernalis (Camboatá), Myrcianthes pungens (Guaviyú), Luehea divaricata (Francisco Alvarez), Ocotea acutifolia (Laurel Negro), Feijoa sellowiana (Guayabo del País), Eugenia uniflora (Pitanga),Calliandra tweedii Benth. (Plumerillo Rojo), como características de este tipo de bosque.

Información de interes de la reserva de flora y fauna

 Geología

Se trata de una extensión geográfica situada al extremo sur de la plataforma brasileña, que forma el zócalo cristalino del país.

Se han mantenido en el devenir del tiempo por tratarse de una estructura más o menos horizontal donde se han depositado sucesivas coladas.

Se sitúa en la falda sur de la cuesta basáltica (Cuchilla Negra), que cuenta con 200 a 300 metros de altura promedio, orientada al sur entre dos laderas que se estrechan hacia la cima.

El material geológico preponderante es el basalto depositado en el terciario que corona la ladera alta y forma el cauce las aguas que escurren de las laderas superiores.

Microclima y suelo

En la zona de grutas y quebradas se encuentran lugares con microclima característico, donde casi no existen vientos ni heladas, con 2 o 3 grados centígrados de diferencia con el campo abierto y elevada humedad relativa.